本校原為台北市五省立中學新店聯合分部，創設於民國四十四年八月，由省立第一女子中學主辦，譚任叔先生為分部主任。民國五十三年為配合政府省辦高中、縣辦初中之政策，獨立為「台北縣立五峰初級中學」。譚任叔先生奉派為本校首任校長。民國五十七年秋，政府實施延長九年國民教育，改制為「台北縣立五峰國民中學」。民國七十八年八月奉准招收夜間國中補校。民國九十九年配合台北縣改制為新北市，改名為「新北市立五峰國民中學」。

民國五十九年四月譚校長奉准退休，繼任者有張積祥、周紹民、顧延畢、陳政雄、陳慶明、吳錦明、傅朝華、陳瑛姍、羅珮瑜諸先生，至民國一百零玖年八月由呂治中校長接掌本校。

本校由省立北一女分部創始迄今，歷經五十五年之久，由原獨立後之十三班已增至九十二班（補校三班），學生人數已由原六百五十人增至三千六百餘人（含補校學生）。其間由於譚校長本諸篳路藍縷、以啟山林之精神，填泥沼築道路，除蔓草闢校園，歷任校長更積極規劃、收購校地、增建校舍，綠化美化環境，整建操場（PU跑道及壓克力球場），充實設備以提供更美好的學習場所，讓學生使用更完善的設施，擁有更大的活動場地。